Kimia Organik II (2SKS) adalah mata kuliah kelanjutan Kimia Organik I. Materi mata kuliah Kimia Organik II pada paruh waktu pertama sebelum UTS masih membahas materi dasar Kimia Organik yaitu pemahaman tentang senyawa golongan asam karboksilat dan turunannya, senyawa amina, heterosiklis dan hidrokarbon aromatis polisiklis. Pada paruh kedua setelah UTS, materi kuliah meliputi senyawa biomolekul yaitu karbohidrat, asam amino dan protein, lipid, asam nukleat serta warna dan zat warna.